FX's Shōgun is een originele bewerking van James Clavells roman en speelt zich af in Japan in het jaar 1600 aan het begin van een eeuwenlange burgeroorlog. Lord Yoshii Toranaga vecht voor zijn leven als zijn vijanden in de Raad van Regenten zich tegen hem verenigen, wanneer een mysterieus Europees schip gestrand wordt aangetroffen in een nabijgelegen vissersdorp.